Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDB1Q16531 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms