Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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