Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNGA3Q16281 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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CNGA3Q16281 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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CNGA3Q16281 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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CNGA3Q16281 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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CNGA3Q16281 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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CNGA3Q16281 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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CNGA3Q16281 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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CNGA3Q16281 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
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CNGA3Q16281 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CNGA3Q16281 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CNGA3Q16281 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CNGA3Q16281 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNGA3Q16281 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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