Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC6Q16204 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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