Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC85BQ15834 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC85BQ15834 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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