Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMGN3Q15651 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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