Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIX1Q15475 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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