Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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SYCP1Q15431 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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SYCP1Q15431 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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SYCP1Q15431 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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