Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PUM3Q15397 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
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