Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF4Q15306 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms