Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRKQ15262 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRKQ15262 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
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