Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD3Q15054 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD3Q15054 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD3Q15054 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD3Q15054 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD3Q15054 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD3Q15054 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD3Q15054 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD3Q15054 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD3Q15054 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLD3Q15054 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLD3Q15054 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms