Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NWD1Q149M9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NWD1Q149M9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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