Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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GPNMBQ14956 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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GPNMBQ14956 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPNMBQ14956 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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