Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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