Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IKBKEQ14164 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms