Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM53BQ14153 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms