Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
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COL4A6Q14031 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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