Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PMS2P11Q13670 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PMS2P11Q13670 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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