Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCH1Q13635 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
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