Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CUL4AQ13619 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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