Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL1Q13616 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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