Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LSAMPQ13449 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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