Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms