Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SKP2Q13309 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SKP2Q13309 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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