Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTGDRQ13258 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTGDRQ13258 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTGDRQ13258 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTGDRQ13258 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGDRQ13258 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PTGDRQ13258 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTGDRQ13258 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTGDRQ13258 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PTGDRQ13258 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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