Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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ERCC8Q13216 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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ERCC8Q13216 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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ERCC8Q13216 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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ERCC8Q13216 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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ERCC8Q13216 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ERCC8Q13216 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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