Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SEMA3BQ13214 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEMA3BQ13214 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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