Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NR1H3Q13133 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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NR1H3Q13133 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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NR1H3Q13133 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NR1H3Q13133 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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