Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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IFT88Q13099 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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IFT88Q13099 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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IFT88Q13099 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT88Q13099 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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IFT88Q13099 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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IFT88Q13099 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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IFT88Q13099 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT88Q13099 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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