Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTP4A2Q12974 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTP4A2Q12974 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTP4A2Q12974 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTP4A2Q12974 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTP4A2Q12974 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTP4A2Q12974 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTP4A2Q12974 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTP4A2Q12974 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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