Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOXC1Q12948 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXC1Q12948 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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