Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SREBF2Q12772 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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