Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TGM3Q08188 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TGM3Q08188 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms