Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms