Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN1BQ07699 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms