Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTDSPL2Q05D32 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms