Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR4Q05215 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR4Q05215 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms