Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP7AQ04656 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms