Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBE1Q04446 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBE1Q04446 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms