Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H3F3AP84243 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms