Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX1P83916 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX1P83916 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX1P83916 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX1P83916 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX1P83916 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX1P83916 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX1P83916 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX1P83916 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX1P83916 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX1P83916 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX1P83916 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX1P83916 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms