Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SIM1P81133 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SIM1P81133 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIM1P81133 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIM1P81133 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIM1P81133 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SIM1P81133 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms