Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX6P78412 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX6P78412 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX6P78412 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX6P78412 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX6P78412 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms