Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAE1P78406 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAE1P78406 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAE1P78406 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAE1P78406 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAE1P78406 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAE1P78406 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAE1P78406 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAE1P78406 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAE1P78406 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAE1P78406 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAE1P78406 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAE1P78406 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAE1P78406 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAE1P78406 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAE1P78406 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAE1P78406 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAE1P78406 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAE1P78406 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms