Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P63132 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P63132 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms