Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P62684 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms