Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
RPS29P62273 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
RPS29P62273 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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