Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRPF1P55201 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms