Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GDF10P55107 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GDF10P55107 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF10P55107 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF10P55107 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF10P55107 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF10P55107 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF10P55107 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF10P55107 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF10P55107 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF10P55107 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF10P55107 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF10P55107 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF10P55107 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF10P55107 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF10P55107 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF10P55107 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF10P55107 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GDF10P55107 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDF10P55107 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDF10P55107 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDF10P55107 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDF10P55107 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GDF10P55107 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms